Qué hace hoy

Mide qué tan favorable es el clima de un departamento en una semana para Aedes aegypti, en una escala continua de 0 a 1.

Para seguir el cálculo con ejemplos y un laboratorio, ver la ficha enriquecida de M1.

Datos: temp_media y humedad_relativa_media de ERA5-Land y precipitation_sum de ERA5, a través de Open-Meteo. Si falta alguna de las tres variables, la semana se omite; no se imputa.

Fórmulas, con las mismas constantes del experimento de anticipación:

• f_T, curva de Brière: f_T(T) = c · T · (T − Tmin) · √(Tmax − T) dentro de [16 °C, 38 °C], y 0 fuera. La constante c no viene publicada; se calcula numéricamente para que el máximo de f_T en ese intervalo sea 1 (c ≈ 0,000795).
• f_R, logística sobre la lluvia acumulada en dos semanas (la actual y la anterior, sin pasar de un año a otro): f_R(R) = 1 / (1 + e^(−k·(R−R0))), con R0 = 30 mm y k = 0,1.
• f_H, rampa lineal propuesta por el equipo: f_H(HR) = min(1, max(0, HR/50)). El documento de partida pedía penalizar la humedad relativa por debajo del 50 % sin dar fórmula, y ni Mordecai et al. ni la tesis de la UES la especifican. Se eligió la forma más simple que cumple ese requisito.
• Iv = f_T × (0,3 + 0,7·f_R) × f_H.

Endpoints: GET /api/v1/spatial/current y GET /api/v1/temporal/{codigo}.

M1 no clasifica el riesgo de brote ni anticipa una temporada.

Mide qué tan inusual es el Iv de un departamento en una semana respecto de su propia historia climática.

Para seguir el cálculo con ejemplos y un laboratorio, ver la ficha enriquecida de M2.

Método: puntuación z de Iv por departamento y semana del año, calculada sin el año que se describe (leave-one-out). La línea base va de 2014 al año en curso (ADR 0018), así que cada año nuevo cambia las desviaciones históricas. Se compara la misma semana exacta, sin semanas vecinas. El reanálisis ERA5 llega con unos 5 días de retraso.

Se muestra como serie continua (anomaly_sigma). El experimento de anticipación usaba un umbral de Z ≥ 1,5 durante dos semanas seguidas; se retiró porque se cruzaba en todos los años evaluados y no distinguía unos de otros. M2 no emite alertas ni expone lead_time_weeks.

Mide qué tan alta es la cifra de casos ya observados en un departamento en una semana, comparada con su propia historia.

Para seguir el cálculo con ejemplos y un laboratorio, ver la ficha enriquecida de M3.

La fórmula completa está en el documento del módulo 3.

Endpoints: GET /api/v1/presion/current y GET /api/v1/presion/temporal/{codigo}.

M3 no usa el clima ni emite alertas. Un percentil alto compara lo ya ocurrido con los otros años del mismo departamento.

Canal endémico

El panel «Canal endémico» dibuja los mismos cortes de M3 como tres bandas: casos hasta el P50 (baja), entre el P50 y el P75 (media) y por encima del P75 (alta), con los casos observados encima. Usa la línea base de M3, que deja fuera el año descrito, así que la banda cambia de un año a otro. Las semanas sin línea base suficiente quedan en blanco.

El canal endémico es el último paso de la ficha enriquecida de M3.

Da tres datos sobre la calidad de la información, por separado:

• Completitud geográfica: cuántos de los 14 departamentos tienen dato esa semana, y cuántas semanas de cada año están completas.
• Cuadre del boletín: si la suma de los departamentos coincide con el total nacional publicado en el mismo PDF, y por cuánto difiere cuando no.
• Antigüedad: semanas desde la última observación de cada serie (dengue MINSAL, OpenDengue, tablero de MINSAL, clima, IRA y neumonías de los boletines y del tablero, virus). Explica por qué la serie departamental de dengue termina en 2023. No mide el retraso entre el caso y la publicación del boletín, porque esa fecha no está en la base.

Endpoint: GET /api/v1/vigilancia/integridad. En el mapa es la capa «Integridad de la vigilancia».

Un departamento sin color en esta capa es un departamento sin dato esa semana.

Para seguir cada métrica con ejemplos y un laboratorio, ver la ficha enriquecida de M4.

Muestra los 14 departamentos. Los datos se unen al mapa por el nombre normalizado, porque la fuente de límites trae vacío el código ISO 3166-2 (ADR 0002). La capa inicial son los casos semanales de MINSAL, probables o confirmados. El selector de capas añade M1, M2 y las dos series de M3.

El mapa no pinta niveles de riesgo por departamento.

Usa los mismos boletines de MINSAL, pero otras tablas, y desde 2025 el tablero de MINSAL. Está en /respiratorio, con IRA y neumonías como secciones de la página.

• Serie nacional de IRA y de neumonías: casos notificados por semana según el tablero de MINSAL, desde 2025, con una línea por año, la última semana comparada con la misma de un año antes, las semanas sin publicar y una tabla con los valores. Endpoints: GET /api/ira/nacional y GET /api/neumonias/nacional.

• Neumonías: conteo clínico por departamento, acumulado desde la semana 1, con clasificacion = 'notificado' y tipos_evento = 'neumonia'. No se mezcla con IRA.

• IRA: el mismo tipo de conteo notificado (ADR 0011), en serie acumulada y semanal, con 2.742 filas en la copia actual de la base.

• Vigilancia de laboratorio nacional (ADR 0012): muestras, detecciones y positividad de influenza, VSR y SARS-CoV-2, en la tabla vigilancia_virus_respiratorios. COVID-19 aparece como fila propia en 2023. No hay mapa por departamento de virus.

• Un panel de cobertura indica qué semanas y qué tablas hay.

Las fórmulas de M1 a M3 solo están definidas para dengue, así que esta sección no las usa.

Las alertas las redacta y publica el equipo de vigilancia (ADR 0013 y 0015). Cada una tiene tipo (dengue o respiratorio), nivel (informativo, atencion o intensificacion), título, contexto, indicaciones, fuente, autor, vigencia, estado activa y una etiqueta opcional (test, simulacro o historica). La página pública /alertas lista solo las activas sin etiqueta, igual que GET /api/alertas por defecto.

Para publicar o editar se usan POST /api/alertas y PATCH /api/alertas/{id} con una clave definida en el servidor (ALERTAS_TOKEN, cabecera Bearer). No hay tabla de usuarios ni DELETE: una alerta se desactiva y pasa al archivo, en /alertas/archivo. El formulario /alertas/nueva no aparece en la navegación.

Los cinco campos clínicos (ADR 0014) se llenaron por tipo de alerta transcribiendo VIGEPES y OPS, con la fuente citada. Si la fuente no da un dato, el campo queda en null; en respiratorio pasa con los signos de alarma y los criterios de referencia. El sistema no rellena teléfonos ni correos.

Las alertas no se generan a partir de M1 a M3 ni del clasificador retirado.

El service worker está escrito a mano (public/sw.js), sin dependencias. La estructura del sitio se sirve desde la caché y se actualiza en segundo plano. GET /api/alertas va primero a la red, porque mostrar como vigente una alerta ya desactivada tendría consecuencias clínicas; la caché solo se usa sin conexión. Lo que viene de la caché lleva _desde_cache: true en el JSON y la página muestra la fecha de esa copia. El indicador va en el cuerpo y no en una cabecera porque la API está en otro dominio y CORS no deja leer cabeceras propias.

• Descarga de 264 PDF de boletines MINSAL (2018 a 2023, sin 2020), comprobando que cada archivo empiece por %PDF.
• Lectura de las tablas departamentales: hay dos formatos, que se distinguen en cada documento por la presencia de la columna de tasa y no por el año. Las cifras de probables y confirmados vienen acumuladas desde la semana 1 y se pasan a semanales restando. Los huecos y las correcciones retroactivas no se reparten entre semanas.
• Registro de cada boletín en boletines_procesados (ADR 0004 y 0007), con estado ok, ausencia_esperada, sin_texto_extraible, revision_manual, error o pendiente.
• Carga de la serie nacional de OpenDengue (clasificacion = 'total', ADR 0005) y del clima de Open-Meteo (ERA5-Land y ERA5, ADR 0006).
• Carga de las series nacionales del tablero de MINSAL desde capturas del tablero guardadas desde el navegador (clasificacion = 'sospechoso' para dengue, ADR 0021). No hay descarga programada.
• Semanas epidemiológicas de OPS/CDC (MMWR) con la librería epiweeks.

En esa fuente una celda vacía de MINSAL significa 0 y se carga así. Un hueco por vacaciones no se convierte en una cifra interpolada.